Судьи ФАС Восточно-Сибирского округа в постановлении от 13.10.2009 № А33-16226/08 рассмотрели ситуацию, когда налоговики отказали в вычете НДС из-за  неправильно оформленного счета-фактуры. Контрагент выставил компании документы с ошибкой. Впоследствии, обнаружив ошибку, поставщик их заменил. Новые счета-фактуры сопровождались письмом с указанием, где и какие изменения были внесены.

По мнению налоговиков, заменить счет-фактуру можно только в течение пяти дней с момента отгрузки, а этот срок уже истек. Это значит, что контрагент должен был внести исправления в ранее выставленные документы и заверить их печатью и подписью. Однако судьи поддержали компанию: основанием для отказа в вычете может быть только несоблюдение требований пунктов 5 и 6 статьи 169 Налогового кодекса РФ. Статья 169 не запрещает изготавливать новые счета-фактуры.