Налоговики не смогут отказать в вычете по НДС по тем счетам-фактурам, которые подписаны разными сотрудниками. Такой вариант возможен, если в компании налажен внутренний электронный документооборот. Тогда головная организация может выставить документ, а филиал - распечатать его для покупателя. И если подписывают такие счета-фактуры уполномоченные на то лица, проблем с вычетом не возникнет.

Недавно об этом сообщали чиновники Минфина. Теперь ФНС России своим письмом от 19.07.2013 г. № ЕД-4-3/13161@ подтвердила данную позицию.