Если до момента завершения реорганизации уточненный расчет по форме 6-НДФЛ не был представлен реорганизованной организацией, то такой расчет подлежит представлению правопреемником в налоговый орган по месту своего учета.

В случае осуществления перерасчета сумм НДФЛ за период, который относится к деятельности ликвидированного обособленного подразделения, следует представить в налоговый орган по месту учета налогового агента уточненный расчет по форме 6-НДФЛ за соответствующий отчетный период с указанием ИНН и КПП налогового агента, а ОКТМО - ликвидированного обособленного подразделения.

Отмечено также, что по строке 090 расчета указывается общая сумма налога, подлежащая возврату налоговым агентом налогоплательщикам в соответствии со статьей 231 НК РФ, нарастающим итогом с начала налогового периода.

Письмо ФНС России от 13.03.2019 N БС-4-11/4405@