Действительно, подоходный налог является расходом для предприятия при применеии данной системы налогообложения в соответствии пп. 22 ст.346.16 гл. 26.2 II часть НК РФ.( суммы налогов и сборов, уплаченные в соответствии с законодательством Российской Федерации о налогах и сборах (пп. 22 введен Федеральным законом от 31.12.2002 N 191-ФЗ).
В соответствии со ст. 207 Налогового Кодекса РФ плательщиками являются физические лица.

Но поскольку перечисленный в бюджет НДФЛ удерживается организацией из доходов работника, то никаких расходов по уплате налога она фактически не несёт. Следовательно, для целей обложения единым налогом суммы удержанного и перечисленного в бюджет НДФЛ сами по себе не учитываются (п.2 ст. 346.16, п.1 ст. 252 НК РФ). Но в расходы работадателя, применяющего УСНО, включается оплата труда работников с учётом НДФЛ (при условии,что удержанный при выплате заработанной платы НДФЛ бы перечислен в бюджет (пп 6. п.1 ст. 346.16, п.2 ст. 346.17 НК РФ).